Утилита повышает привилегии до уровня TrustedInstaller и легко решает эти проблемы.
RunAsTI.exe - запуск процесса под System с привилегиями trustedinstaller
RunAsTI.exe /s - запуск процесса под System
Install.cmd - копирует файлы и добавляет в контекстное меню пункт "Run as trustedinstaller"...